A principal diferença está na queima do combustível. Os motores do ciclo Diesel não possuem velas ou sistema de ignição, e o processo de queima do combustível se dá quando o ar se inflama por causa do calor gerado pela pressão, que é exercido pelo movimento do pistão que comprime o ar contra o cabeçote. Pela alta taxa de compressão e pelas características do combustível, o motor a diesel alcança maior rendimento. Os motores do ciclo Diesel são mais duráveis e têm manutenção simplificada.
Já os motores do ciclo Otto (gasolina/etanol/GNV), a queima do combustível se dá pelo acionamento de uma vela de ignição, que queima a mistura ar/combustível, quando comprimida dentro da câmara de combustão. Pelas características dos combustíveis, a queima se processa mais rápido e, em comparação com o diesel, seu rendimento é menor.
(Fonte: MWM Motores Diesel)